Dependiendo la distrinución, tras la instalación necesitamos un tiempo extra para dejarla a punto, instalando los programas, herramientas y configuraciones de nuestro interes que a diario usamos; por suerte, en GNU/Linux existen herramientas que ayudan a la creación de distros perzonalizadas; te vendrá como anillo al dedo si regularmente instalas Linux en diferentes máquinas.
En LinuxAdmin he visto una lista de estas aplicaciones que te ayudarán a crear tu propia distro; verás cuanto tiempo te ahorras. xD!
Remastersys: Para distros basadas en Debian (incluye Ubuntu), trabaja a partir de un Debian o Ubuntu ya instalado.
UCK: como su nombre indica, kit de customización de Ubuntu, toma como base una iso del sistema operativo.
Reconstructor: toma como base Debian 5 y ubuntu 9.04 y 9.10, se hace a partir del navegador web pidiéndonos que nos registremos previamente, es muy parecido a SuseStudio.
Revisor: Para customizar distros basadas en Fedora, en lo personal me ha ido genial con este programa
SuseStudio: para distros basadas en *Suse
Pungi: Esta herramienta va por linea de comandos para crear distros basadas en Fedora
Builder: son script que usan los chico de gNewSense para crear su distro. Para distros ubuntu
Linux-Live: herramienta bastante avanzada para gente con conocimientos amplios del sistema, sirve para distros Slackware, estos scripts se usan para crear Slax
Linux From Scatch: Amazing. Paso a paso para construirte tu distro a partir del código fuente.
Actualización
Alejandro suguiere Catalyst, para Live-Gentoos
